Aufgrund des Syntheseprinzips wird die Struktur eines NRPs durch die Art, Anordnung und Anzahl der Module bestimmt, aus denen das zugehörige Montageband aufgebaut ist. Die Art der Module legt die Natur der verwendeten Aminosäuren fest, ihre Anordnung die Aminosäure-Sequenz im Produkt und ihre Anzahl die Größe des synthetisierten Peptides.
Durch Austausch, Addition oder Deletion von Modulen können spezifische und vorhersagbare Veränderungen in die Struktur eines NRPs eingeführt werden. Dies kann ausgenutzt werden:
- um gezielte Veränderungen in die Primärstruktur eines beliebigen Peptid-Wirkstoffes einzuführen
- um biokombinatorische Bibliotheken von Naturstoffen und Naturstoff-Derivaten zu erzeugen
- um artifizielle Montagebänder für nahezu jedes Peptid zu generieren
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